Спустя 80 лет после событий Fallout, уединённая деревня Арройо, основанная Выходцем из убежища, начала приходить в упадок. Требовались новые силы, чтобы вдохнуть жизнь в поля. Старейшина деревни посылает Избранного (персонаж может быть как мужского, так и женского пола) в пустоши за чудом довоенной инженерной техники — ГЭКК (англ. GECK, Garden of Eden Creation Kit, Генератор Эдемских Кущ Компактный), предназначенный для рекультивации послевоенной земли вышедшими жителями убежищ. Избранный вновь отправляется в опасные поиски...